Как Mongo item reader обновляет / воссоздает запрос страницы между заданиями?
Из кода, как я видел, единственный способ обновить запросы страницы-установить read.count в контексте выполнения шага. При запуске задания количество чтения в контексте выполнения шага равно 0 или пусто, поэтому запрос страницы не будет обновляться
Я полагаю
AbstractItemCountingItemStreamItemReader.saveState, что свойство должно решить вашу проблему